В 1969 году, после очередного районирования Москвы образовался один из крупнейших в то время новый район города – Красногвардейский. Район протянулся вдоль Каширского шоссе. С одной стороны – Москва-река, с другой – Варшавское шоссе. В старом здании бывшего военного госпиталя на Каширском проезде разместилась районная санэпидстанция. Половину первого этажа в 300 кв. м занимал санитарно-гигиенический отдел, половину – химическая и микробиологическая лаборатория. Эпидотдел разместился в трех комнатах на третьем этаже этого административного здания, всю остальную площадь которого занимал райвоенкомат.
Возглавил новую структуру АКСЕНОВ Василий Петрович.
Кроме городской застройки на территории района располагался колхоз им. В. И. Ленина с громадными садами, клубничными полям и коровниками на 700 коров…Все это – нынешний район Орехово-Борисово, Бирюлево, Загорье, Братеево, построенные в восьмидесятые года 20-го века.. Именно в это время санитарная служба вникла и разработала основы предупредительного санитарного надзора, на стадии проектирования, строительства, что, безусловно, выгодно для государства , населения. Это было время, когда единичный случай кори вызывал активность здравоохранения города, т.к. приравнивался к ЧП, в 43 пионерских, спортивных лагерях отдыхали дети района, интернатов. И родители, соответственно, летом тоже отдыхали, т.к. не беспокоились о детях, находившихся под присмотром.
В 1978г главным санитарным врачом районной СЭС стала заведующая эпидемиологическим отделом ВОРОНОВИЧ Зинаида Федоровна.
В 1979г в районе произошла крупная авария на городском канализационном коллекторе, из-за чего в Борисовские пруды хлынули фекалии всего юга города…. Зона отдыха была уничтожена и потребовалось десятилетие на очистку прудов. С тех пор регулярно высевался холероподобный вибрион в воде прудов…В 1985г З.Ф. Воронович перешла на работу в Райздравотдел на должность начальника.
На должность главного врача в июне 1985г был назначен заведующий санитарно-гигиеническим отделом АННЕНКОВ Павел Роевич, а в августе загорелась лаборатория санэпидстанции. За один день (!) было демонтировано и вывезено все оборудование лабораторий, благо через два дома пустовали помещения бывшей лаборатории Советского района г. Москвы. Год шел капитальный ремонт, и затем, в один день, все оборудование было возвращено на свое место. Тогда же и началась работа по выделению места под строительство, вхождение в план развития, проектирование, согласования и строительство нового здания по Ореховому бульвару, д.26, строение 2. На это ушли годы…
В конце 80-х годов районы: Красногвардейский, Пролетарский, Советский и часть Москворецкого района, объединилось под названием Южный административный округ города Москвы. Санитарную службу в округе начал представлять Центр Госсанэпиднадзора в Южном административном округе г. Москвы, возглавляемый Главным государственным санитарным врачом, являющимся одновременно заместителем главного государственного санитарного врача по городу Москве, АННЕНКОВЫМ Павлом Роевичем.
В июне 2000г., в связи с переходом Анненкова П. Р. в Северо-Западный административный округ г. Москвы, главным государственным санитарным врачом Центр Госсанэпиднадзора в ЮАО назначен ЛАТКИН Александр Тимофеевич, занимавший эту должность до 2003 года, затем его сменил ПАНТЕЛЕЕВ Герман Юрьевич.
Следующая реконструкция службы последовала в марте 2005г. Центр Госсанэпиднадзора в ЮАО разделился на территориальный отдел Управления Роспотребнадзора по городу. Москве в Южном административном округе г. Москвы, возглавляемый Главным государственным санитарным врачом по ЮАО ПАНТЕЛЕЕВЫМ Г. Ю. и филиал ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в городе Москве» в ЮАО, главным врачом которого стал БАГДИЯН Сергей Арсенович.
В состав ТО УРПН вошел отдел защиты прав потребителей (ранее – Торгинспекция Южного округа), руководителем которого трудится БОЙКО Роза Михайловна
В настоящее время коллектив филиала ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в городе Москве» в ЮАО обеспечивает противоэпидемическую работу в округе, осуществляет социально-гигиенический мониторинг Южного округа города, выполняет экспертные функции при проведении надзорных мероприятий территориальным отделом.
Испытательно-лабораторный Центр при филиале осуществляет широкий спектр исследований воздуха, воды, почвы, пищевых продуктов и т.д., как в надзорных целях, так и по заявкам населения или организаций.